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标题: cp2k导出的电子密度和静电势cube计算极值点格点不匹配的问题 [打印本页]

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自留地    时间: 2024-9-26 20:10
标题: cp2k导出的电子密度和静电势cube计算极值点格点不匹配的问题
各位好,我利用cp2k做DFT计算导出的cube文件(周期性体系,计算需要)可以用卢老师的方法(使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图http://sobereva.com/443)在VMD中成功画出静电势图,由此可以判断cube文件并没有问题。但是,我在利用Multiwfn计算极值点时一直遇到如下问题:
Error: The grid setting of this cube file is inconsistent with that of the grid data stored in memory!

我的具体做法如下:
Multiwfn density.cub
12    //表面定量分析
5      //导入外部cube函数文件
3      //确认选择外部文件进行插值
0      //开始分析,此时会产生cube template file并提示输入静电势cube文件,我在输入esp.cub之后就出现了上述问题

我分析的原因:esp.cub和density.cub 格点是完全一致的,而template.cub是电子密度0.001 a.u.的isosurface cube,所以跟cp2k产生的不可能一致。

那么,如何产生跟template.cub一致的esp.cub呢?(实在是抱歉,cube文件过大,无法上传)

还请大家指点。拜谢



作者
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sobereva    时间: 2024-9-26 23:01
目前主功能12不支持周期性体系,以后会支持




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