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标题: MS的Dmol3计算过渡态出现异常结构求助 [打印本页]

作者
Author: zhaoquanyou 时间: 2024-9-28 17:54
标题: MS的Dmol3计算过渡态出现异常结构求助
各位大佬，我在MS搜索过渡态的时候，出现了这个结构，不明白是为什么，把输入文件和最终的结构文件粘下来，请大家帮我看看是为什么
输入文件# Task parametersCalculate                   ts_path
Max_path_points             10
Opt_energy_convergence       1.0000e-04
Opt_gradient_convergence    2.0000e-02 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-02 A
Opt_iterations             50
Symmetry                   off
Max_memory                   2048
File_usage                   smart
Scf_density_convergence    1.000000e-05
Scf_charge_mixing          2.000000e-02
Scf_diis                   6 pulay
Scf_iterations             500

# Electronic parameters
Spin_polarization          restricted
Charge                      0
Basis                      dnd
Pseudopotential             none
Functional                   pbe
Aux_density                hexadecapole
Integration_grid             medium
Occupation                   thermal 0.0010
Cutoff_Global                3.5000 angstrom

# Kpoint definition file (intervals/offset):
Kpoints                      file    1 2 1 0.0000 0.0000 0.0000
MFO__1_1_0__H2O2-MFO__1_1_0__H2O2.kpoints

# Calculated properties

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-9-28 21:54
也许你应该打包上传下看看，我不清楚你实际截图的结构到底是什么过程产生的。

作者
Author: zhaoquanyou 时间: 2024-9-29 11:02

卡开发发发表于 2024-9-28 21:54
也许你应该打包上传下看看，我不清楚你实际截图的结构到底是什么过程产生的。

好的好的，我把文件打包一下，然后上传到附件中

作者
Author: zhaoquanyou 时间: 2024-9-29 11:11
这是计算文件的内容，谢谢各位大佬能指出问题

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-9-29 18:38

zhaoquanyou 发表于 2024-9-29 11:11
这是计算文件的内容，谢谢各位大佬能指出问题

有个隐藏文件arc和outmol带上来看看。

作者
Author: zhaoquanyou 时间: 2024-10-8 17:38

卡开发发发表于 2024-9-29 18:38
有个隐藏文件arc和outmol带上来看看。

outmol这个文件太大了，上传不上来，愁死了arc的文件也找不到，人生啊

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-10-8 18:23

zhaoquanyou 发表于 2024-10-8 17:38
outmol这个文件太大了，上传不上来，愁死了arc的文件也找不到，人生啊

arc文件是隐藏文件，所以你需要调整下文件夹相关设置。

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