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标题: 博文664中的IRI-pi图颜色变化明显,而本人做出的图却同一个颜色? [打印本页]

作者
Author:
赵云跳槽    时间: 2024-9-29 10:59
标题: 博文664中的IRI-pi图颜色变化明显,而本人做出的图却同一个颜色?
博文664中的IRI-pi图颜色变化明显,而本人做出的图却同一个颜色?
这是博文664的IRI-pi图,颜色变化明显
(, 下载次数 Times of downloads: 4)
本人做的图,完全是一个色
(, 下载次数 Times of downloads: 3)

Multiwfn计算步骤
C18Br6-opt+freq.fchk
19
1
6
26
0
0
130-159   //这里我认为的pi轨道,虽和作者有差异,但颜色变化应该不会这么明显
2
q
-1
100
1
1,100
3
3 //导出fun1.cub和fun2.cub,后续直接用VMD中的source IRIpifill.vmd命令

请问我的过程错在什么地方?求指教,谢谢
附件我上传我使用的fchk文件

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-30 03:35
IRIpifill.vmd默认的色彩刻度范围是-0.08到0.08,直接作出来的图是什么样?
论文中的色彩刻度上下限可能是合作者标错了

使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html
上文说的原文里,绘制IRI-pi用的都是-0.08到0.08,使得绿-蓝能对应电子密度从0到较大的区域。

作者
Author:
赵云跳槽    时间: 2024-9-30 09:15
重复出来了
色彩刻度范围是-0.08到0.08(默认的)
(, 下载次数 Times of downloads: 1)
步骤为

C18Br6-opt+freq.fchk
19
1
6
26
0
0
132,136-140,149,150,153-159
2
q
-1
100
1
1,100
3
3





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