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标题: 为什么分步模拟的时候，容易出现Segmentation fault [打印本页]

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-9-29 13:28
标题: 为什么分步模拟的时候，容易出现Segmentation fault
我在模拟的时候，有时候需要进行分步模拟，比如要添加A和B两种物质，一次性添加A和B时就不会出现报错，但是如果在
程序1：先加A，然后以这个的最后一个状态当作一个新的模拟的初始状态加B离子时。
程序2：先加B，然后以这个的最后一个状态当作一个新的模拟的初始状态加A离子时。
就在em npt md时出现Segmentation fault，而且程序1和程序2出现的时候也不一样。如何解决我是知道的，参照Sobtop (sobereva.com)，但是想了解一下出现这个问题的比较原理性的原因。因为步骤都是一样的，但为什么有的时候会出现错误有的时候不会，和体系有关吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-30 02:33
取决于怎么加的，如果加的方式不当，导致一开始位阻互斥强烈，必然容易崩

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Author: Willow0114 时间: 2024-9-30 12:32

sobereva 发表于 2024-9-30 02:33
取决于怎么加的，如果加的方式不当，导致一开始位阻互斥强烈，必然容易崩

那请问sob老师，加的方式不当具体是指什么呢？有什么判断依据吗？

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Author: sobereva 时间: 2024-10-1 00:16

Willow0114 发表于 2024-9-30 12:32
那请问sob老师，加的方式不当具体是指什么呢？有什么判断依据吗？

原子间有过近接触，导致一开始斥力太大、加速度太大，然后速度太大，MD就崩了

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