计算化学公社

标题: 提问关于研究聚合物与客体分子间的弱相互作用时的结构构建是否合理 [打印本页]

作者
Author: panMD 时间: 2024-10-5 10:32
标题: 提问关于研究聚合物与客体分子间的弱相互作用时的结构构建是否合理
      当时有提问过：拟计划研究PET纤维与染料分子间的弱相互作用，由于聚合物的体系较大，若在构建过程中只构建单个或两个重复单元来代替聚合物，将结构优化后的单个重复单元和单个染料分子按照初猜摆放好作为研究体系，研究出来的是否合理，是否需要考虑构建过程中PET结构要比染料分子的大？

      sob老师的回复是：PET的结构显然要比染料分子的大得多，要不然边界效应太强。

      所以我想进一步提问：那这类研究中，我在Gview中将该重复单元平移复制成长链，大概四到五个单元（或适当再增加），边界用氢饱和，是否合理（这样的计算耗时已经很长了）。还是更应该去考虑使用“使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用”这个方法（http://sobereva.com/540）去研究我这个体系。

      下图的顺序分别为染料分子，PET结构式，PET的单个重复单元。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-5 10:41
2个太少，5个又有点浪费，3、4个就可以，不至于耗时多高。200-300个原子以内如今做DFT计算都不是难事

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