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标题: cp2k计算z方向的电荷密度分布,得到的cub文件和在wfn上面的密度差局部积分曲线不同 [打印本页]

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李思玫    时间: 2024-10-7 18:39
标题: cp2k计算z方向的电荷密度分布,得到的cub文件和在wfn上面的密度差局部积分曲线不同
本帖最后由 李思玫 于 2024-10-8 09:42 编辑

[attach]99130[/attach]cub文件显示电荷差分集中在中间的小分子上面,但是采用Multiwfn,载入密度差格点数据文件EDD.cub,然后进入主功能13,再进入子功能18,绘制局部积分曲线如图1所示,在基底上面也有电荷密度差分布,而且数值较大,从vesta直接观察EDD.cube文件,密度差分布在中间小分子上面(如图二),且isosurface值为0.02,数值也与Multiwfn绘制的局部积分曲线纵坐标不同。
不知道是什么原因导的两点:(1)数值范围vesta的isosurface值为0.02,Multiwfn绘制的局部积分曲线纵坐标范围是-4-3左右。
(2)vesta直接观察EDD.cube文件密度差分只显示在吸附小分子上面,Multiwfn绘制的局部积分曲线沿z方向分布时,两端处于基底坐标也有较大的密度差分

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李思玫    时间: 2024-10-7 19:06
补充一下:vesta里面的Isosurface值是0.02,原则上wfn上面做的z方向密度差分值范围不应该也是0.2左右吗,但是图1纵坐标范围是-5到3
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sobereva    时间: 2024-10-8 03:38
李思玫 发表于 2024-10-7 19:06
补充一下:vesta里面的Isosurface值是0.02,原则上wfn上面做的z方向密度差分值范围不应该也是0.2左右吗,但 ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

仔细看下文,说清楚wfn指的是什么
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

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李思玫    时间: 2024-10-8 09:43
sobereva 发表于 2024-10-8 03:38
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

感谢sob老师,我已经修改




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