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标题: 在singularity沙箱里安装GAMESS,运行时必须输入完整路径是怎么回事 [打印本页]

作者
Author:
wanlichuan    时间: 2024-10-8 08:38
标题: 在singularity沙箱里安装GAMESS,运行时必须输入完整路径是怎么回事
本帖最后由 wanlichuan 于 2024-10-30 17:05 编辑

请教大家,我在singularity沙箱里安装GAMESS(VERSION = 30 SEP 2021),沙箱的操作系统是ubuntu20.04,MKL是intel_oneapi_2021.3.0,安装过程基本按教程来(https://wxyhgk.com/article/ubuntu-gamess)。在实体机和虚拟机中都成功了,在沙箱中runall测试全部成功,但是实际运行时遇到一个问题:

运行时必须定位到rungms所在的目录,否则提示“command not found”:
即,用下面的指令可以运行(ubuntu2004是沙箱的名字):
Singularity> $HOME/ubuntu2004/home/gamess/rungmsname.inp 00 4
用下面的指令都会出错:
Singularity> gmsname.inp 00 4
bash: gms: command not found
甚至直接把name.inp拷到gamess目录下,在gamess目录下运行rungms也会出错:
Singularity> rungmsname.inp 00 4
bash: rungms: command not found (此时rungms就在当前目录下

望不吝赐教,谢谢。


作者
Author:
abin    时间: 2024-10-8 12:34
自己动手

https://blog.csdn.net/hpc4you/article/details/124328959
https://blog.csdn.net/hpc4you/article/details/124419142
https://blog.csdn.net/hpc4you

如果看不懂,
可以一对一教学. ^_^

作者
Author:
wanlichuan    时间: 2024-10-8 16:40
好的,谢谢,我学习一下。




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