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标题: 求助CP2K的metadynamics的CV设置问题 [打印本页]

作者
Author: bentty_lee 时间: 2024-10-8 16:39
标题: 求助CP2K的metadynamics的CV设置问题
主要有两个问题：
1. 最近在学习metadynamics怎么在CP2k中实现，但是感觉线上手册讲的不是很详细。以https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL/SUBSYS/COLVAR/QPARM.html 这个链接为例，我在CP2K官方手册看到它的COLVAR设置并没有详细的公式说明，也没有参考文献可以追寻，请问各位大神，哪里可以找到这些CV的公式来源啊。
2. 我想根据附件的参考文献，设置一下Q4dot为我的CV，我看了好像并没有现成的COLVAR可以用，是不是只能通过&COMBINE_COLVAR来自己定义了？

作者
Author: 丁越 时间: 2024-10-9 09:12
COLVAR是反应坐标，CP2K自己的MTD模块里有许多内置的反应坐标类型，比如距离、配位数、角度等作为反应坐标（https://manual.cp2k.org/trunk/CP ... /SUBSYS/COLVAR.html）。一些简单反应坐标的理解就是它的字面意思，不需要什么详细的公式说明，比如距离、角度等。一些复杂的反应坐标定义都会给相应定义公式，比如这个官网教程里面就写了配位数如何定义的（https://manual.cp2k.org/trunk/methods/sampling/metadynamics.html）。

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