计算化学公社

标题: cp2k 2024.3版本中，md卡住的问题解决了吗 [打印本页]

作者
Author: gejuqing 时间: 2024-10-10 10:59
标题: cp2k 2024.3版本中，md卡住的问题解决了吗

This is a minor release to fix an issue with the PW environment that can lead to stalls during MD (#3661).

有谁更新了2024.3版本，想问下新版本里跑md时卡住不动的bug修好了吗

作者
Author: logzzz 时间: 2024-10-10 15:54
本帖最后由 logzzz 于 2024-10-10 15:56 编辑

感觉应该是修复了吧，反正2是会卡住，我都用2023.2跑。

https://github.com/cp2k/cp2k/releases/tag/v2024.3

作者
Author: reid 时间: 2024-10-10 17:14

logzzz 发表于 2024-10-10 15:54
感觉应该是修复了吧，反正2是会卡住，我都用2023.2跑。

https://github.com/cp2k/cp2k/releases/tag/v20 ...

2024.1计算CI-NEB有时也莫名其妙的卡住不动了，是不是也是一样的bug

作者
Author: logzzz 时间: 2024-10-10 18:18

reid 发表于 2024-10-10 17:14
2024.1计算CI-NEB有时也莫名其妙的卡住不动了，是不是也是一样的bug

可以尝试更换核数和版本计算。我之前优化都会有卡住的。这可能跟编译环境什么的都有关系。

作者
Author: reid 时间: 2024-10-12 20:48

logzzz 发表于 2024-10-10 18:18
可以尝试更换核数和版本计算。我之前优化都会有卡住的。这可能跟编译环境什么的都有关系。

应该不是，相同的文件，有时跑300步都不卡，但重新启动时十几步就卡住

作者
Author: 牧生 时间: 2024-10-12 20:57
实测仍然偶有卡住，ctrl+c中断后，运行restart可以继续跑

作者
Author: gejuqing 时间: 2024-10-18 09:55

牧生发表于 2024-10-12 20:57
实测仍然偶有卡住，ctrl+c中断后，运行restart可以继续跑

以前AIMD算四步就卡住，运行restart以后续算4步又卡住，你有遇过这样的情况吗

作者
Author: 牧生 时间: 2024-10-18 10:26

gejuqing 发表于 2024-10-18 09:55
以前AIMD算四步就卡住，运行restart以后续算4步又卡住，你有遇过这样的情况吗

不是，跑了一段时间后，突然不动了。只遇到过一次

作者
Author: Quantum198907 时间: 2024-10-19 12:10
并行尝试换成mpich~~~~openmpi出现这个问题的概率大一点

作者
Author: abin 时间: 2024-10-19 14:46

Quantum198907 发表于 2024-10-19 12:10
并行尝试换成mpich~~~~openmpi出现这个问题的概率大一点

这个方案靠谱。

OpenMPI多数情况下飞快，
不过容易挂……

MPICH和IntelMPI兼容，
这两个稳定性稍微好一些……
虽然有些案例，可能会慢一丢丢……

鄙人觉得，稳定可靠应该更重要。

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