计算化学公社

标题: 请问RDKIT计算氢键供体,受体的规则是什么 [打印本页]

作者
Author:
liangt    时间: 2024-10-10 13:37
标题: 请问RDKIT计算氢键供体,受体的规则是什么
下面两种方法计算出的结果不一样,第二种的规则是怎么样的?
from rdkit import Chem
from rdkit import rdBase, Chem
from rdkit.Chem import PandasTools, QED, Descriptors, rdMolDescriptors
mol2 = Chem.MolFromSmiles('Clc1ccc(OC2CCN(CC2)C3CCN(CC3)C(=O)c4ccc(cc4)c5nn[nH]n5)cc1Cl')
hbd = rdMolDescriptors.CalcNumLipinskiHBD(mol2)
hba = rdMolDescriptors.CalcNumLipinskiHBA(mol2)
print(hbd,hba)
结果为1   8
HBA = Lipinski.NumHAcceptors(mol)
HBD = Lipinski.NumHDonors(mol)
print(HBD,HBA)
结果为1,6

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作者
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liangt    时间: 2024-10-11 20:43
本帖最后由 liangt 于 2024-10-14 15:04 编辑


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liangt    时间: 2024-10-17 14:28





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