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标题: xtb如何在分子动力学实现拉伸(拉长金链)? [打印本页]

作者
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liyuan(小白)    时间: 2024-10-10 16:25
标题: xtb如何在分子动力学实现拉伸(拉长金链)?
求xtb如何在分子动力学实现拉伸(拉长金链)?

作者
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sobereva    时间: 2024-10-10 16:55
没法直接实现
ORCA或CP2K做动力学倒是可以,恰当定义CV并定义CV如何随时间变化
作者
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liyuan(小白)    时间: 2024-12-9 22:05
sobereva 发表于 2024-10-10 16:55
没法直接实现
ORCA或CP2K做动力学倒是可以,恰当定义CV并定义CV如何随时间变化

老师的意思是用orca或者cp2k的xtb模块吗?、在单纯的xtb中有没有命令可以在分子动力学中固定原子?
作者
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sobereva    时间: 2024-12-10 02:38
liyuan(小白) 发表于 2024-12-9 22:05
老师的意思是用orca或者cp2k的xtb模块吗?、在单纯的xtb中有没有命令可以在分子动力学中固定原子?

固定和拉伸完全是两码事
固定是能固定,但没法设置怎么拉伸
作者
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liyuan(小白)    时间: 2024-12-10 11:30
sobereva 发表于 2024-12-10 02:38
固定和拉伸完全是两码事
固定是能固定,但没法设置怎么拉伸

老师可以给一下固定的方法吗? FIX在分子动力学里直不生效




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