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标题: 请教一下对二面角扫描时去除不连续但是不在意的点是否合理 [打印本页]

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Author: 吹梦到西洲 时间: 2024-10-10 17:33
标题: 请教一下对二面角扫描时去除不连续但是不在意的点是否合理
请问各位老师，我为了研究两个分子之间的扭转角度，人为定义了两个分子之间的二面角（没有键连），想研究其在-20到20之间的势能面情况。图中横坐标为两个分子间二面角的角度，纵坐标为柔性扫描得到的能量。
由于分子比较大使用的是gfn2-xtb的方法。角度为0的结构是我手动摆上去的，但是事实上我并不关心0的能量。
因为正负30以后有能量突变。我可否选取-20到20的一系列点算单点能，然后0处的能量突变忽略（0处并不是我关心的）？
图是我目前做的从0到-40，和0到40的两次扫描的组合（如果直接从-40到40 结构变化的厉害）。

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