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标题: CP2K是否适合做COF晶体层间滑移的AMID研究 [打印本页]

作者
Author: naoki 时间: 2024-10-10 19:04
标题: CP2K是否适合做COF晶体层间滑移的AMID研究
如题，我想基于AIMD研究COF晶体不同层之间滑移过程的能量变化，该COF两层之间通过轮烷互锁。感觉这个过程类似NEMD，或者能否通过柔性扫描实现？目前没有好的思路，遂请教大家。
如果难以实现，我就用经典的拉伸动力学去做了。

作者
Author: 吞木木 时间: 2024-10-10 20:31
AIMD应该不是很容易实现这个过程，计算量会有点大，可以考虑
cp2k+plumed联用，采用增强采样的方法

作者
Author: wolfli369 时间: 2024-10-11 09:58

吞木木发表于 2024-10-10 20:31
AIMD应该不是很容易实现这个过程，计算量会有点大，可以考虑
cp2k+plumed联用，采用增强采样的方法

请问有cp2k+plumed的相关教程吗？最好有具体的样例分析，劳烦你分享点

作者
Author: 吞木木 时间: 2024-10-11 16:32

wolfli369 发表于 2024-10-11 09:58
请问有cp2k+plumed的相关教程吗？最好有具体的样例分析，劳烦你分享点

https://manual.cp2k.org/trunk/methods/sampling/metadynamics.html

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-11 19:18
在CP2K里定义CV，设为一个点和一层的一个原子之间的距离，并且设置在动力学过程中让这个CV随时间变化
或者自己写程序，层平移一定距离计算一次能量

作者
Author: naoki 时间: 2024-10-12 00:19

吞木木发表于 2024-10-10 21:31
AIMD应该不是很容易实现这个过程，计算量会有点大，可以考虑
cp2k+plumed联用，采用增强采样的方法

谢谢~我琢磨一下

作者
Author: naoki 时间: 2024-10-12 00:20

sobereva 发表于 2024-10-11 20:18
在CP2K里定义CV，设为一个点和一层的一个原子之间的距离，并且设置在动力学过程中让这个CV随时间变化
或者 ...

谢谢sob大，我去尝试一下

作者
Author: wolfli369 时间: 2024-10-12 16:08

吞木木发表于 2024-10-11 16:32
https://manual.cp2k.org/trunk/methods/sampling/metadynamics.html

收到，谢谢

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