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标题: CALYPSO软件相关问题 [打印本页]

作者
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黑色桃花    时间: 2024-10-10 19:41
标题: CALYPSO软件相关问题
各位老师好,最近在学习CALYPSO软件,遇到如下问题:
1. 运行它所提供的TEST文件,一个BN晶体预测,在提供的in.bat文件中,最大代数是50,难道真的要跑50代吗,这个文件我跑了,的确是跑到了50代,但是在他自身文件所带的result文件中仅有6代。我现在都不知道是谁的问题,我这跑的过程中没报错,一直在跑。还有就是我想问下,它怎么看结果满足精度要求,就是咋样算是结束了,难道非得跑到最大代数嘛

2. VASP需要INCAR,这是肯定的,但是他这个TEST需要三个INCAR,这个哪里说了,这是为啥呢,而且手册是提到需要数个INCAR,但是在In.dat中哪里体现了呢

3. 这个软件是怎么产生POSCAR的呢,随机的吗,但是在input.dat的输入文件中,提到了原子的种类和数量,但是怎么在产生初始构型的过程中判断我所想要的构型呢,就比如我给了8个C原子及其他原子,其中有甲基的存在,那他是否会判定我给到的是个八元环呢(我只是举个例子),这个过程是随机的吗,其次,calypso这个软件的代码目前是只能对分子结构进行晶体预测吗,如果是离子化合物可以吗,或者说在产生第一代构型前,我能先提供一个我想要的坐标信息文件吗


请老师们给看看我的问题,学生不胜感激,谢谢!

作者
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logzzz    时间: 2024-10-10 22:04
1.最大代数是50代。一般情况并不是需要都跑完,在已经搜索不出新结构的前提下可以结束。
2.INCAR 这需要三个是为了加速收敛,calypso产生结构的方式的随机撒点,所以一开始优化会特别困难,用不同精度优化,是更快得到理想结构。
3.calypso是随机生成结构的,但用户可以自定义需要的空间对称性等要求。按要求搜索结构。
4.calypso最擅长是预测原子晶体,离子化合物也可以,电子化合物,反而是分子晶体预测是最近几年才开始。
5.在蔻享学术有calypso之前办过的培训课程,你可以线上观看,另外calypso每年都会组织线下交流会。如果决定以后靠这个做科研,有条件可以去参加。
6.calypso有专门的用户群,你可以进群咨询。




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