计算化学公社
标题:
rdf分析水结冰自定义被统计组问题
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作者Author:
Layman
时间:
2024-10-18 14:03
标题:
rdf分析水结冰自定义被统计组问题
各位大佬,请教一下。
在文献中看到进行盐水结冰模拟后,rdf分析时,可以对固相(图中备注s曲线)液相(备注aq)区分分析,sob老师给出建议是,自定义被统计的组,让组里的原子对应相应部分。我现在的问题是,在水结冰中固相和液相都在不断变化,自定义被统计的组通过何种方式可以更迭?
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作者Author:
sobereva
时间:
2024-10-20 15:42
自己写VMD tcl脚本,循环各帧,每帧都取当前结构下冰和水内部区域的一些分子算rdf,然后把rdf结果取时间平均
作者Author:
Layman
时间:
2024-10-21 10:16
sobereva 发表于 2024-10-20 15:42
自己写VMD tcl脚本,循环各帧,每帧都取当前结构下冰和水内部区域的一些分子算rdf,然后把rdf结果取时间平 ...
好的,谢谢老师
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