计算化学公社

标题: 求助m062x和wb97xd对于含金属镍体系的单点能计算 [打印本页]

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-19 09:01
标题: 求助m062x和wb97xd对于含金属镍体系的单点能计算
求助，我正在计算含金属镍催化的有机反应动力学热力学分析。对于一些含金属镍及配体的结构，我使用m062x/def2tzvp进行优化，之后是否有必要使用wb97xd/def2tzvpp去计算单点能？（考虑到m062x对的主族特性）

作者
Author: aaq2800 时间: 2024-10-19 09:04
为嘛不直接用wb97xd优化？

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-19 09:32

aaq2800 发表于 2024-10-19 09:04
为嘛不直接用wb97xd优化？

wb97xd很容易出现各种不收敛，从几何优化到SCF。虽然一定概率能解决，但对于复杂一点的体系就非常麻烦。文献中也有直接使用M062x的，所以我就用了m062x做优化，的确简单了很多。

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-19 10:04

leoliu 发表于 2024-10-19 09:32
wb97xd很容易出现各种不收敛，从几何优化到SCF。虽然一定概率能解决，但对于复杂一点的体系就非常麻烦。 ...

各位老师评价一下使用wb97xd进行单点能计算的合理性，我主要是害怕泛函的方法在数学设计上有某种不兼容，这样就是科学性问题了。

作者
Author: wal 时间: 2024-10-19 14:57
切泛函算单点倒是没什么问题，但是拿M06-2X优化过渡金属体系，这个真的合适吗

作者
Author: zhangxy 时间: 2024-10-19 16:15
确实，需要考虑M06-2X优化过渡金属体系是否合理
参考http://sobereva.com/272

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-20 10:27

zhangxy 发表于 2024-10-19 16:15
确实，需要考虑M06-2X优化过渡金属体系是否合理
参考http://sobereva.com/272

是的，但是我只涉及热力学计算，对于激发态等等都不涉及，而且主要是有机体系。所以我才想发上来问问

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-20 10:30

leoliu 发表于 2024-10-20 10:27
是的，但是我只涉及热力学计算，对于激发态等等都不涉及，而且主要是有机体系。所以我才想发上来问问

一个大有机体系里也就只有一个金属原子

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-20 14:50

leoliu 发表于 2024-10-19 09:32
wb97xd很容易出现各种不收敛，从几何优化到SCF。虽然一定概率能解决，但对于复杂一点的体系就非常麻烦。 ...

M06-2X的问题远多于wB97XD！别盲目效仿文献。M06-2X又贵又难收敛又容易出虚频，没事甭用这个做opt freq
你这么计算自找被审稿人comment，仔细看下文
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415（http://bbs.keinsci.com/thread-9878-1-1.html）
并且仔细看下文
不同DFT泛函的HF成份一览
http://sobereva.com/282（http://bbs.keinsci.com/thread-807-1-1.html）

优化用PBE0-D3(BJ)。单点用什么取决于反应发生在哪，对于Gaussian用户，牵扯过渡金属成键断键用PBE0-D3(BJ)或MN15，其它情况把具体反应式贴出来

作者
Author: leoliu 时间: 2024-10-20 14:55

sobereva 发表于 2024-10-20 14:50
M06-2X的问题远多于wB97XD！别盲目效仿文献。M06-2X又贵又难收敛又容易出虚频，没事甭用这个做opt freq
...

谢谢老师！

作者
Author: luckyresearcher 时间: 2025-8-29 11:21

sobereva 发表于 2024-10-20 14:50
M06-2X的问题远多于wB97XD！别盲目效仿文献。M06-2X又贵又难收敛又容易出虚频，没事甭用这个做opt freq
...

老师好，想请教老师一个跟原贴相关泛函的问题。我的反应主体是附件这个磺胺类物质，想对比高铁酸钾降解这个物质和羟基自由基降解的产物和单点能。我尝试选一种泛函能够平衡过渡金属、自由基、且有大共轭体系（老师您提过大共轭体系建议用wB97XD，不知道这个物质算不算大共轭体系）。然后去做结构优化和过渡态搜索时，试了b3lyp、m062x、PBE0和wB97XD，该加色散矫正的都加了。想问老师，这种情况，最适合用哪个泛函呢？以及后续单点能计算时，是分别考虑物质本身最适合的泛函，还是对比单点能时也建议统一泛函呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-29 17:48

luckyresearcher 发表于 2025-8-29 11:21
老师好，想请教老师一个跟原贴相关泛函的问题。我的反应主体是附件这个磺胺类物质，想对比高铁酸钾降解这 ...

可以用MN15
如果能量不需要横向对比，就可以用各自最适合的，否则用描述这三种情况相对较为均衡的MN15（或者精度更好的双杂化泛函revDSD-PBEP86-D3(BJ)。如果会用ORCA，则建议用更好的wB97M-V）

作者
Author: luckyresearcher 时间: 2025-9-1 13:01

sobereva 发表于 2025-8-29 17:48
可以用MN15
如果能量不需要横向对比，就可以用各自最适合的，否则用描述这三种情况相对较为均衡的MN15（ ...

谢谢老师，如果考虑过渡金属不参与配位反应，高铁酸钾在水中分解时，仅通过单电子转移产生自由基攻击有机污染物，此时选wB97XD是否比较合适呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-2 09:15

luckyresearcher 发表于 2025-9-1 13:01
谢谢老师，如果考虑过渡金属不参与配位反应，高铁酸钾在水中分解时，仅通过单电子转移产生自由基攻击有机 ...

可以

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