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标题: 如果模拟蛋白质+钙磷离子+激素小分子的体系，力场选哪种比较合适？ [打印本页]

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-10-19 19:03
标题: 如果模拟蛋白质+钙磷离子+激素小分子的体系，力场选哪种比较合适？
如题所示，想要构建一个蛋白质+钙磷离子+激素小分子的体系，力场选择哪个比较好呢？另外对于激素小分子的力场文件是通过charmm-gui生成的，是否只能用CHARMM类的力场。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-20 14:20
AMBER描述蛋白质，小分子用sobtop创建基于GAFF或GAFF2的拓扑文件。我不知道你说的钙磷离子具体是什么，用sobtop肯定可以创建拓扑文件。

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