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标题: ORCA几何优化无法正常进行 [打印本页]

作者
Author: 赵香兰 时间: 2024-10-21 16:30
标题: ORCA几何优化无法正常进行
老师们好！
我现在使用的是ORCA6.0版本,Windows系统，可以正常进行构象分析，但是在进行结构优化时，将之前得到的16个构象进行批量优化时报错。

由于无法在.inp文件中调用坐标文件，只能将分子坐标直接附在.inp文件中。当只添加一个构象的分子坐标时，可以正常运行，把16个分子坐标都加进去时就会报错（应该可以进行批量计算吧？是不是需要使用MPI进行并行计算？）。在使用MS-MPI进行并行运算时发现，当我的核心数设置为1，maxcore为1000MB时，将一个分子坐标附在.inp文件时可以正常运行，16个分子坐标都加进去时依然报错。

当我的核心数设置>1时，任何.inp文件运行时都会出错。（我的服务器时Windows系统的，应当配合MS-MPI使用，这个是正确的吧？）
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希望各位老师可以给与帮助，十分感谢！！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-21 17:28
并行调用orca时必须给出orca的完整路径。手册讲如何并行调用orca的时候专门提了

作者
Author: 赵香兰 时间: 2024-10-21 20:55
本帖最后由赵香兰于 2024-10-21 20:56 编辑

wzkchem5 发表于 2024-10-21 17:28
并行调用orca时必须给出orca的完整路径。手册讲如何并行调用orca的时候专门提了

C:\Users\Administrator\Pictures\屏幕截图 2024-10-21 204942.png
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老师，我试了一下，完整路径也不行

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-21 21:00

赵香兰发表于 2024-10-21 13:55
老师，我试了一下，完整路径也不行

上传完整输入输出文件

作者
Author: 赵香兰 时间: 2024-10-21 21:10

wzkchem5 发表于 2024-10-21 21:00
上传完整输入输出文件

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-21 21:35

赵香兰发表于 2024-10-21 14:10

分子坐标格式不对，不能连着写多个"* xyz ... *"

作者
Author: aaq2800 时间: 2024-10-22 07:57
格式应当是这样的

!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart  miniprint nopop
%id "1"
%maxcore  5000
%pal nprocs  4 end
%geom maxIter 400 end
* xyz 0 1
。。。。。
*

$new_job
!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart  miniprint nopop
%id "2"
%maxcore  5000
%pal nprocs  4 end
%geom maxIter 400 end
* xyz 0 1
。。。。。
*

作者
Author: 赵香兰 时间: 2024-10-22 09:43

wzkchem5 发表于 2024-10-21 21:35
分子坐标格式不对，不能连着写多个"* xyz ... *"

感谢指导，现在单个分子坐标的已经可以运行了，正在尝试将多个分子坐标放在一个文件中运行。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-10-22 09:51

赵香兰发表于 2024-10-22 02:43
感谢指导，现在单个分子坐标的已经可以运行了，正在尝试将多个分子坐标放在一个文件中运行。

不是所有软件都允许把多个分子坐标放在同一个文件里优化的

作者
Author: 赵香兰 时间: 2024-10-24 21:11

aaq2800 发表于 2024-10-22 07:57
格式应当是这样的

!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart miniprint ...

根据您给出的格式，对三个构象分子进行了连续的优化，但是运行时间长达9小时，单个运行每个构象分子大概半小时左右，请问可能是什么原因导致的这种差异呢？是orca不适用这种连续优化，还是我调用的核心数不匹配呢？附有输入文件，输出文件过大以图片形式上传，供参考。
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作者
Author: aaq2800 时间: 2024-10-25 07:51
本帖最后由 aaq2800 于 2024-10-25 07:52 编辑

这个我就不知道啥原因了，我这么用感觉都正常

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