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标题: 求助:用cp2k计算MoS2时使用CI-NEB的收敛不了怎么回事? [打印本页]

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xxxx531    时间: 2024-10-22 20:06
标题: 求助:用cp2k计算MoS2时使用CI-NEB的收敛不了怎么回事?
用cp2k的计算两层2H-MoS2滑移时能垒,但使用的CI-NEB收敛不了怎么回事?
我使用的sobNEB插了七个点,然后用multiwfn输出NEB.inp,其中设置了周期性为XYZ,理论方法PBE,开启了smearing,k点设置为3,3,1,还加入了范德华修正:
&VDW_POTENTIAL
        POTENTIAL_TYPE  PAIR_POTENTIAL
        &PAIR_POTENTIAL
        R_CUTOFF    9     #Range of potential. The cutoff will be 2 times of this value
        TYPE        DFTD3
        PARAMETER_FILE_NAME  dftd3.dat        REFERENCE_FUNCTIONAL PBE
        LONG_RANGE_CORRECTION T
        &END PAIR_POTENTIAL
跑了15个小时100步自动停止了,但是输出结果只有一个能够达到官方收敛标准的始终只有RMS FORCE这一项,其他三项基本还差得多。请问是步数设置不够大吗?还是其他参数没有设置好的原因?
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插点文件: (, 下载次数 Times of downloads: 4)
计算文件: (, 下载次数 Times of downloads: 7)


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sobereva    时间: 2024-10-23 12:39
可以尝试多跑100步
很多情况100步NEB都不足以达到收敛。从BAND TOTAL ENERGY [au]可以看到能量还在单调变化而没有震荡
作者
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xxxx531    时间: 2024-10-23 16:15
sobereva 发表于 2024-10-23 12:39
可以尝试多跑100步
很多情况100步NEB都不足以达到收敛。从BAND TOTAL ENERGY [au]可以看到能量还在单调变 ...

好的老师,我再尝试一下。
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xxxx531    时间: 2024-10-24 11:07
本帖最后由 xxxx531 于 2024-10-24 11:11 编辑
sobereva 发表于 2024-10-23 12:39
可以尝试多跑100步
很多情况100步NEB都不足以达到收敛。从BAND TOTAL ENERGY [au]可以看到能量还在单调变 ...

老师,我现在跑了164步之后收敛了,但是画出来的能垒图有两个最高点,而且和我之前算的起末态和中间过渡态的单点能不一致,这是怎么回事?起末态和中间过渡态对于的插点是第一个、第七个、第四个点。
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单点能和neb文件如下: (, 下载次数 Times of downloads: 1) (, 下载次数 Times of downloads: 2)

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sobereva    时间: 2024-10-24 12:27
xxxx531 发表于 2024-10-24 11:07
老师,我现在跑了164步之后收敛了,但是画出来的能垒图有两个最高点,而且和我之前算的起末态和中间过渡 ...

点数太少时,如果期间还有中间体,显然体现不出来

参考http://bbs.keinsci.com/thread-49211-1-1.html里我的回复

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xxxx531    时间: 2024-10-26 23:29
本帖最后由 xxxx531 于 2024-10-26 23:38 编辑
sobereva 发表于 2024-10-24 12:27
点数太少时,如果期间还有中间体,显然体现不出来

参考http://bbs.keinsci.com/thread-49211-1-1.html ...

老师,我插了12个点,还是出现两个峰的状态,而且始末态和过渡态的单点能和我neb算出来的能垒的值不一样呢?起末态和中间过渡态对于的插点是第1个、第12个、第7个点。
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sobereva    时间: 2024-10-26 23:49
xxxx531 发表于 2024-10-26 23:29
老师,我插了12个点,还是出现两个峰的状态,而且始末态和过渡态的单点能和我neb算出来的能垒的值不一样 ...

显然说明中间有极小点,拿第7个点优化极小点
之前我的回复里说了参考另一个帖子里我的回复,搞清楚原理

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xxxx531    时间: 2024-10-27 19:18
sobereva 发表于 2024-10-26 23:49
显然说明中间有极小点,拿第7个点优化极小点
之前我的回复里说了参考另一个帖子里我的回复,搞清楚原理
...

好的,谢谢老师




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