计算化学公社

标题: 求助-计算葡萄糖在石墨烯表面的结合自由能选择什么软件模拟合适 [打印本页]

作者
Author: lemon1044 时间: 2024-10-23 00:08
标题: 求助-计算葡萄糖在石墨烯表面的结合自由能选择什么软件模拟合适
我想首先，模拟葡萄糖在石墨烯表面如何吸附，然后在计算其吸附自由能，请问NAMD和gromacs哪个比较合适，抑或者QE更合适

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-23 12:13
CP2K基于DFT（如PBE-D3(BJ)）做最合适，又免费又巨快，结合Multiwfn创建输入文件又很容易上手和使用。北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里专门讲了表面体系的计算、自由能的热力学量的计算
QE太慢

GROMACS等基于力场的程序也可以用，但是精度明显不及DFT，而且还牵扯创建拓扑文件的麻烦过程。

作者
Author: lemon1044 时间: 2024-10-23 20:51

sobereva 发表于 2024-10-23 12:13
CP2K基于DFT（如PBE-D3(BJ)）做最合适，又免费又巨快，结合Multiwfn创建输入文件又很容易上手和使用。北京 ...

ok，谢谢你，我再去下载一个CP2K

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)