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标题: 如何根据自由能形貌图提取能量最低、最稳定的构象? [打印本页]

作者
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12313    时间: 2024-10-25 15:06
标题: 如何根据自由能形貌图提取能量最低、最稳定的构象?
各位老师好,我的体系是蛋白配体复合物,模拟轨迹时长为50ns,我根据RMSD值、Rg值通过gmx sham 命令绘制了自由能形貌图,之后根据shamlog.log和b index.ndx文件寻找能量最低点,发现能量最低状态对应的帧数非常多,想问一下各位老师这种情况,该怎么找到复合物能量最低、构象最稳定所对应的帧数?

作者
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sobereva    时间: 2024-10-26 00:00
origin绘制散点图时直接就能把散点对应的序号显示出来
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12313    时间: 2024-10-26 12:44
sobereva 发表于 2024-10-26 00:00
origin绘制散点图时直接就能把散点对应的序号显示出来

请问sob老师,绘制散点图用的是哪个数据文件呀?




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