计算化学公社

标题: 求助分子刚性表征计算 [打印本页]

作者
Author:
fucose    时间: 2024-10-27 22:21
标题: 求助分子刚性表征计算
合成了几个有机荧光分子,初步测下来荧光量子产率和分子刚性(直观上)有比较好的correlation,计算小白求助如何定量或半定量表征这种关系。是MD去算RMSF还是应该计算相关振动频率?还是应该把内转换速率都算出来?

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-10-28 01:14
刚性没有唯一衡量方式。RMSF可以,但这通常衡量的是分子整体的,而与实际研究的问题有关的有可能是局部刚性(当然对局部也可以算RMSF)
当内转换是非辐射退激的主要通道时,能算出来内转换速率来讨论当然最好




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