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标题: gromacs可以使用初始位置速度文件续跑吗 [打印本页]

作者
Author: 1154975925 时间: 2024-10-29 23:05
标题: gromacs可以使用初始位置速度文件续跑吗
本帖最后由 1154975925 于 2024-10-29 23:07 编辑

我目前有平衡后蛋白质的.coor，vel，xsc文件，然后有一个加了水和离子的pdb文件，我能否用这个来进行gromacs模拟呢，因为这个.coor，.vel，.xtc文件是namd得来的，但是namd模拟速度实在太慢了，我想用gromacs进行模拟，不知道可不可行，下图是我NAMD平衡后的文件[attach]100689[/attach] (, 下载次数 Times of downloads: 5) (, 下载次数 Times of downloads: 1)

作者
Author: Seyilaxa 时间: 2024-10-29 23:40
不同程序的文件当然不能混用

用pdb文件在gromacs重新搭体系再平衡也就最多半小时的事

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