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标题: vmd能不能把1250帧全部扫描保存成一个pdb？ [打印本页]

作者
Author: Ruzhuang 时间: 2024-10-30 19:19
标题: vmd能不能把1250帧全部扫描保存成一个pdb？
我在amber里边跑了1250帧，然后在vmd中用拓扑配上轨迹文档，我想截取一下离肽链3埃米以内的所有的蛋白质残基，因为每一帧都不一样的构象，我想把1250帧只要距离蛋白3埃都截下来保存成一个pdb文档，这样能做到吗？肽链是6个残基的

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-31 16:06
用动态选区时，VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃，没有埃米

作者
Author: Ruzhuang 时间: 2024-10-31 19:37

sobereva 发表于 2024-10-31 16:06
用动态选区时，VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃，没有埃米[/backcolor ...

谢谢sob老师

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