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标题: BOMD输入文件请教 [打印本页]

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Author: a-Student 时间: 2024-11-1 15:25
标题: BOMD输入文件请教
本帖最后由 a-Student 于 2024-11-3 07:48 编辑

老师打扰您一下，如图1利用gaussain计算BOMD看下分析分子动力学过程，输入文件想跑700个点，步长为0.5fs，但是文件报错输入不对，关于BOMD输入讨论比较少没有找到怎样更正，所以想请教下老师，我知道ORCA比较方便，但是想尝试下gaussian，麻烦请老师指点下，谢谢老师

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Author: sobereva 时间: 2024-11-1 19:04
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）极为全面讲了Gaussian的BOMD的用法并给了各种例子，其中最简单的一个例子：

(, 下载次数 Times of downloads: 2)

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Author: JCenter 时间: 2024-11-2 00:06

sobereva 发表于 2024-11-1 19:04
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）极为全面讲了Gaussian ...

老师，高级量化班的内容中后续还会增加机器学习以及polyrate计算反应速率的内容吗

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Author: yflchx 时间: 2024-11-2 09:50
StepSize=n
Sets the dynamic step size to n*0.0001, in the appropriate units.

自学要先仔细看手册，看程序自带的示例、测试的输入文件。

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Author: 嘤嘤嘤 时间: 2024-11-4 11:15
老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请问如何解决啊？

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Author: wzkchem5 时间: 2024-11-4 11:38

嘤嘤嘤发表于 2024-11-4 04:15
老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请 ...

注意空行的数目

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Author: 嘤嘤嘤 时间: 2024-11-4 14:14

wzkchem5 发表于 2024-11-4 11:38
注意空行的数目

老师，您说的是末位空行吗？我空了

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Author: sobereva 时间: 2024-11-5 02:00

嘤嘤嘤发表于 2024-11-4 11:15
老师，我按照这个输入应用到我的结构，可是运行几秒后就报错，网上搜了一下解决办法，但是仍旧没有解决，请 ...

北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）里这页ppt专门强调了用genecp时的格式：
(, 下载次数 Times of downloads: 1)

另外，强烈不建议用又慢势能面又往往不光滑的M06-2X做AIMD。不想用B3LYP-D3(BJ)、PBE0-D3(BJ)的话用wB97XD都好得多。当前带弥散又没必要又令耗时暴增又自找麻烦。嫌6-311G**不够的话用def-TZVP是比加弥散好得多得多的做法

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Author: 嘤嘤嘤 时间: 2024-11-5 14:03

sobereva 发表于 2024-11-5 02:00
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html）里这页ppt专门强调了 ...

好的，谢谢老师。

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