计算化学公社

标题: 求助利用VESTA或VMD绘制局部电子密度差图 [打印本页]

作者
Author: tiandiyiti 时间: 2024-11-6 09:20
标题: 求助利用VESTA或VMD绘制局部电子密度差图
我用CP2K计算后产生的cube文件，经过处理得到的电子密度差使用VESTA作图结果如下
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
我想请问一下，如果只想看其中一层结构中的电子密度差，应该如何处理？或者用VMD是否可以实现这个目的？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-9 08:07
如果只想在当前这副图上抹掉其它层的等值面，自己ps就完了，把显示和不显示等值面的图作为两个图层，并且抹掉一部分透出另一层即可

如果从格点数据层面进行处理，用Multiwfn主功能13提供的格点数据屏蔽功能，把距离某一层原子较远的格点的数值都设为0，参考Multiwfn手册4.13.4节的例子

作者
Author: tiandiyiti 时间: 2024-11-9 11:00
谢谢sob老师，听了您的建议，用Multiwfn把问题解决了。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)