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标题: 求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法 [打印本页]

作者
Author:
Joycelv    时间: 2024-11-7 10:28
标题: 求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法
老师您好,我在用GROMACS模拟分子聚集后,想看分子在聚集态下的电荷分布,按照您在《将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法》文中的步骤,我先将分子的gro和xtc文件导入VMD,然后将charge.txt导入到VMD后,VMD就卡死了,由于gro和xtc文件中已经去掉水分子了,所以我后来尝试把charge.txt中的水分子电荷信息也去掉了,但是也是同样的结果。是因为我的分子太大了吗,请问有什么解决办法吗?另外,我是想看分子聚集对分子静电势的影响,不知道这样做是否合理,谢谢老师啦

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-11-7 12:18
帖子标题不得乱用叹号,置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。这次给你改了,下次乱用叹号直接删帖扣分处理。

每次引用我博文时应当自觉给出文章链接,给你加上了


论坛里所有新帖我全都看得到,不要at我,给你去掉了





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