计算化学公社
标题:
求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法
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作者Author:
Joycelv
时间:
2024-11-7 10:28
标题:
求助将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法
老师您好,我在用GROMACS模拟分子聚集后,想看分子在聚集态下的电荷分布,按照您在《
将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法
》文中的步骤,我先将分子的gro和xtc文件导入VMD,然后将charge.txt导入到VMD后,VMD就卡死了,由于gro和xtc文件中已经去掉水分子了,所以我后来尝试把charge.txt中的水分子电荷信息也去掉了,但是也是同样的结果。是因为我的分子太大了吗,请问有什么解决办法吗?另外,我是想看分子聚集对分子静电势的影响,不知道这样做是否合理,谢谢老师啦
作者Author:
sobereva
时间:
2024-11-7 12:18
帖子标题不得乱用叹号,置顶的新社员必读贴以及
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
都明确说了。这次给你改了,下次乱用叹号直接删帖扣分处理。
每次引用我博文时应当自觉给出文章链接,给你加上了
论坛里所有新帖我全都看得到,不要at我,给你去掉了
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
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