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标题: 求助Zn2+对氨基形成配位键有关电子和自旋多重度的设定 [打印本页]

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Zyyyy    时间: 2024-11-12 20:26
标题: 求助Zn2+对氨基形成配位键有关电子和自旋多重度的设定
本帖最后由 Zyyyy 于 2024-11-13 11:02 编辑

我们的想法是在一个3-氨基酚醛树脂的片段上,Zn2+与其上的氨基形成配位键,在书写GJF文件时,对电荷和自旋多重度的设定存在疑问,不知道该怎么设定
因为Zn2+取代了氨基上的一个氢原子形成了配位键,电荷应该设定为1 还是2呢
同时Zn原子的电子结构时3d10 4s2,在失去两个电子之后,Zn2+的电子结构就变成了3d10 此时是不是就成为了一个闭壳层的结构 自旋多重度应该是1 但是尝试了2 1 这样去设置 Gaussian报错了 2 2可以正常运算。

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Solitude198    时间: 2024-11-12 20:48
NH_2   +     Zn^(2+)     ====     NHZn(+)   +   H(+)
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pikachuupup    时间: 2024-11-12 20:49
看你下来的是氢原子还是氢离子,要是下来氢原子的话,总电荷应该是+2,自旋多重度当然是2;要是下来的是氢离子的话才是你说的闭壳层结构,自旋多重度是1,但是这时候总电荷就是+1了
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sobereva    时间: 2024-11-13 04:37
分清楚gif和gjf
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Zyyyy    时间: 2024-11-13 10:46
本帖最后由 Zyyyy 于 2024-11-13 11:02 编辑
sobereva 发表于 2024-11-13 04:37
分清楚gif和gjf

实在抱歉老师  书写错误了

如果按照上面的回复 说明那个氢原子或者离子 在构建模型时 应该放到哪了 因为需要计算结合能 片段的、Zn2+的 、结合到一起的进行比较
需要单独计算一个氢离子或氢原子的单点能吗 还是把氢离子放在无限远的位置与结合到一起的一起进行计算呢

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Zyyyy    时间: 2024-11-13 10:49
pikachuupup 发表于 2024-11-12 20:49
看你下来的是氢原子还是氢离子,要是下来氢原子的话,总电荷应该是+2,自旋多重度当然是2;要是下来的是氢 ...

麻烦再问一下 下来的氢原子或者是氢离子 在做构型搭建的时候 是要放在与基团无线远的地方吗 因为后面还要比较单点能 基团的 Zn2+的 和它们复合在一起的
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pikachuupup    时间: 2024-11-13 16:24
Zyyyy 发表于 2024-11-13 10:49
麻烦再问一下 下来的氢原子或者是氢离子 在做构型搭建的时候 是要放在与基团无线远的地方吗 因为后面还要 ...

单独计算
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Zyyyy    时间: 2024-11-13 19:19
pikachuupup 发表于 2024-11-13 16:24
单独计算

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