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标题: CP2K算MD，不收敛后改设置smearing续跑成功，但是续跑数据能接上前面的数据吗？ [打印本页]

作者
Author: Oliviaw 时间: 2024-11-13 11:55
标题: CP2K算MD，不收敛后改设置smearing续跑成功，但是续跑数据能接上前面的数据吗？
本帖最后由 Oliviaw 于 2024-11-13 12:09 编辑

用CP2K跑一个300多原子的体系的MD， 400多步后就不收敛，或者爆内存，我改了timestep，改了smearing，改了内存后续跑成功。但是我不确定用了smearing，会不会和前面400多步的数据的温度或者能量数据连不上。我总共10000步，担心后面续跑的数据接不上，可能白跑了几天。请问smearing对温度和能量相对于没有设置smearing的时候会不会有不连续的现象？

我后面检查，前400多步也加了smearing。后面续跑是只改了内存设置，用的restart。但是还是希望知道一下万一前面问题的答案。以防下次犯这样的错误。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-13 14:27
爆内存和SCF不收敛完全是两码事，前者是编译/运行环境/并行方式问题，后者怎么解决下文说了
CP2K中遇到SCF难收敛时的解决方法
http://sobereva.com/665（http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html）

smearing要开就从头就开，否则莫名其妙，本来也影响结果

作者
Author: Oliviaw 时间: 2024-11-13 16:08

sobereva 发表于 2024-11-13 14:27
爆内存和SCF不收敛完全是两码事，前者是编译/运行环境/并行方式问题，后者怎么解决下文说了
CP2K中遇到SCF ...

谢谢社长，我看过贴子了，上面写了smearing的部分。
爆内存显示了储存空间不够，和openstack size设置不合理。我改了ulimit -s unlimited/ulimit -m unlimited/注释掉了#export OMP_NUM_THREADS=12/#export MKL_NUM_THREADS=12/#export OMP_STACKSIZE=200MB
CP2K一直在跑，没有报错，但是速度变慢了很多，不知道是内存设置的原因，还是我把步长从1 fs改小为0.5 fs的原因？

作者
Author: JCenter 时间: 2025-3-5 22:56

sobereva 发表于 2024-11-13 14:27
爆内存和SCF不收敛完全是两码事，前者是编译/运行环境/并行方式问题，后者怎么解决下文说了
CP2K中遇到SCF ...

老师，我看cp2k讲义中FPMD部分实例2；高温下烷烃裂解的模拟部分后面建议为开启smearing使共价键解离成自由基的曲线正确。如果在dft下做的是异裂，而非产生自由基，应该不需要使用smearing吧。smearing一般用于gap小的体系，我理解的是均裂成自由基，单电子轨道能量相近，gap低，所以需要开启smearing。如果是异裂，比如水解亲核反应，gap较大，就不需要开启smearing了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-6 02:14

JCenter 发表于 2025-3-5 22:56
老师，我看cp2k讲义中FPMD部分实例2；高温下烷烃裂解的模拟部分后面建议为开启smearing使共价键解离成自 ...

是

作者
Author: JCenter 时间: 2025-3-6 13:45

sobereva 发表于 2025-3-6 02:14
是

感谢卢老师

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