计算化学公社

标题: 如何让 VMD 批量读入 .xyz 文件并计算 SASA? [打印本页]

作者
Author:
Tifo    时间: 2024-11-19 09:27
标题: 如何让 VMD 批量读入 .xyz 文件并计算 SASA?
如题,请问各位老师,我想计算在 LAMMPS 中模拟获得的结构的 SASA 值,准备使用 VMD 的内置命令。目前想的是计算出 dump 文件中的每个时刻的 SASA 值,已通过 Ovito 输出了各个时刻的 .xyz 文件,想问一下各位老师,VMD 可以批量读入这些文件并分别计算 SASA 值么,还是只能一个个手动导入并计算?感谢大家!

作者
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sobereva    时间: 2024-11-19 11:35
自己写VMD tcl脚本,没有干不了的事
作者
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Tifo    时间: 2024-11-19 20:21
sobereva 发表于 2024-11-19 11:35
自己写VMD tcl脚本,没有干不了的事

好吧
作者
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sobereva    时间: 2024-11-20 04:26
Tifo 发表于 2024-11-19 20:21
好吧

好好看下文,避免引起他人不悦!
向“好吧”作为句子开头宣战!
http://bbs.keinsci.com/thread-334-1-1.html
作者
Author:
Tifo    时间: 2024-12-7 12:49
sobereva 发表于 2024-11-20 04:26
好好看下文,避免引起他人不悦!
向“好吧”作为句子开头宣战!
http://bbs.keinsci.com/thread-334-1- ...

明白了,感谢sob老师的提醒,以后一定注意




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