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标题:
求助,对cp2k增强采样的输出CV数值非常疑惑
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作者Author:
mercer
时间:
2024-11-19 17:39
标题:
求助,对cp2k增强采样的输出CV数值非常疑惑
本帖最后由 mercer 于 2024-11-19 17:46 编辑
求助一下各位老师,我使用CP2K进行metadynamics的计算,构建了一个非常简单的算例石墨烯上面有两个HNO3。我定义了NN距离为CV使用了图1的代码。我使用ms测量了初始的NN距离为5左右(图2),在计算时设置了关闭DO_HILLS,没开启偏执势,让程序只输出CV数值(图3)。测试运行了一会发现输出的cp2k-COLVAR.metadynLog文件输出的第二行,也就是我设置的CV数值异常达到了9(图4)。反复测试依旧是这个结果,不知道是我设置有问题对DISTANCE参数使用有误还是对metadynLog的理解有误。输入文件和metadynLog文件已贴在附件。(ps:没有因为初始结构不稳定乱跑的问题,我测量了初始几帧的nn距离都是5左右)
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