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标题: 乙醇水扩散体系贴在板表面问题 [打印本页]

作者
Author: sakura22409 时间: 3 day ago
标题: 乙醇水扩散体系贴在板表面问题
各位老师好，我在学习md，最近需要做一个模拟乙醇水体系氧化铝膜过滤的问题，构造了一层板中间挖孔的模型，使用GROMACS跑完NVT后发现分子在通过孔后会贴在板的表面，没有达到预想的扩散到整个盒子里，由于是初学者没有研究清楚究竟是哪里的设置导致这个结果，想请教一下。
（附件包含两个单独的mdp文件和压缩包11内：初始模型的top，gro以及运行后的gro文件）

作者
Author: sobereva 时间: 前天 05:04
怎么可能扩散在盒子里，板与扩散过去的分子有吸引作用，当然会吸在板上，除非温度高到令扩散过去的分子都呆不住，或者扩散过去的真空区域填充了和分子亲合性较好的溶剂之类

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