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标题: 模拟自组装构建盒子选择packmol还是GROMACS [打印本页]

作者
Author: milk_q 时间: yesterday 10:17
标题: 模拟自组装构建盒子选择packmol还是GROMACS
请问大家使用全原子模拟前药（原子总数在500-1000之间）在水中自组装的动力学行为，构建盒子是使用packmol随机添加多少数量的前药和水分子，还是使用GROMACS添加前药再填充水分子，要模拟它形成凝胶的过程，数量上要怎么选择，，谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: yesterday 11:09
gmx insert-molecules随机插入盒子里，再用gmx solvate加水
数目参考相关问题研究的文献

作者
Author: milk_q 时间: yesterday 14:36

sobereva 发表于 2024-11-26 11:09
gmx insert-molecules随机插入盒子里，再用gmx solvate加水
数目参考相关问题研究的文献

收到谢谢sob老师

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