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标题: ZIF材料的NAMD力场如何生成呢？ [打印本页]

作者
Author: abing 时间: yesterday 17:36
标题: ZIF材料的NAMD力场如何生成呢？
请教一下各位老师，我看到sob老师博文中有提到用sobtop生成MOF的力场文件，但sobtop得到结果都是gromacs格式的。
看到参考文献中有介绍到ZIF-8材料的力场参数，但其他ZIF材料的力场很少找到了。要得到ZIF材料NAMD的力场要怎么去生成呢？
只能参照文献中给出的参数自己去写文件嘛？

作者
Author: sobereva 时间: 6 hour ago
用parmED把sobtop产生的拓扑文件转成NAMD的，要么就用GROMACS。本来GROMACS效率就比NAMD更高、用户多一个数量级，没什么理由非得用NAMD

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