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标题: 求助做AIMD后用VMD计算rdf出错 [打印本页]

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Author: 泡泡鱼1218 时间: yesterday 22:58
标题: 求助做AIMD后用VMD计算rdf出错
老师您好，我在做第一性原子分子动力学（AIMD）之后想用VMD进行分析径向分布函数（RDF），在使用VMD时收到了这样的错误提示，我想请问您这是什么原因，该如何解决呢，谢谢老师！我这个体系存在三种原子Ti、H的同位素原子T、还有He。其中He的含量较少，或者是不是与同位素有关，请各位老师指点。
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作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: yesterday 23:12
标题应该具体到提问内容哦

只写个Ti不够，请看社长博文《VMD里原子选择语句的语法和例子》
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

另外注意VMD里这个RDF计算插件还是有点局限性的，若是要用于非正交盒子或者需要更好的结果可以考虑下GROMACS的gmx rdf功能。

作者
Author: sobereva 时间: 7 hour ago
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “第一性原理AIMD后处理软件VMD” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

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