计算化学公社

标题: grompp提示atomtype not found [打印本页]

作者
Author: milk_q 时间: 2024-11-28 10:09
标题: grompp提示atomtype not found
求助各位大佬，我做的前药自组装，拓扑参数都是sobtop基于Amber，GAFF生成的，
gmx grompp提示
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用的是spc216水模型，
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这是加入水之后的top
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

作者
Author: pal 时间: 2024-11-28 16:19
报错信息里面写了，没有水的原子类型OW_spc

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-28 17:44
引用AMBER力场目录下的ffnonbonded.itp得到对水的原子类型的定义

作者
Author: milk_q 时间: 2024-11-28 19:26

sobereva 发表于 2024-11-28 17:44
引用AMBER力场目录下的ffnonbonded.itp得到对水的原子类型的定义

已解决谢谢sob老师

作者
Author: z1065480896 时间: 2025-3-28 17:45

milk_q 发表于 2024-11-28 19:26
已解决谢谢sob老师

请问直接是定义include在top文件中莫

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