计算化学公社

标题: 关于cp2k的安装与计算异常消耗内存问题 [打印本页]

作者
Author: 汪杰 时间: 2024-11-28 15:24
标题: 关于cp2k的安装与计算异常消耗内存问题
背景：本人电脑里预先装好了intel mpi,然后使用了sob老师提供的教程进行cp2k的安装，
(, 下载次数 Times of downloads: 12)
结果如上，它首先寻找到了intel编译器，然后安装了openmpi，后续就按照流程正常走完。
结果是，成功安装了cp2k，但是在运行时，出现了以下几点问题：

1. 运行途中，pkill cp2k后，没有产生续算文件restart.wfn，只有一个输出日志，我命名为log2的文件，
对于老师给出的算例，我也进行了计算，得到了restart.wfn与log还有一个wfn.bak.1文件，这里只给出log文件了
(, 下载次数 Times of downloads: 3)
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
2. 使用cp2k极其消耗内存，就老师给出的算例而言，竟然花了80多g的内存，我觉得这非常不正常！我之后又算了一个130原子体系，
花了300多g的内存，最后跑完后只给了一个log文件和.kp文件。

请各位给出点意见，解决一下问题。非常感谢！

作者
Author: 汪杰 时间: 2024-11-28 15:26
这里是那个130原子体系的inp文件

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-28 17:48

汪杰发表于 2024-11-28 15:26
这里是那个130原子体系的inp文件

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传，以节约论坛空间、节约下载耗时，以后注意

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-28 17:49
甭用Intel编译器，博文里明明用的是gfortran
编译CP2K之前把.bashrc里和Intel有关的配置都注释掉，重新进入终端后再编译CP2K。并且确保编译过程用的MPI和运行CP2K时活动的MPI是同一个

作者
Author: Santz 时间: 2024-11-28 19:54
显然是你安装得不对，这个任务最大用不到 80G 内存，随手测试了下 CP2K-2024.3（openmpi）和 CP2K-2022.2（intelmpi），前者 112 核最大使用内存 398M，后者 340M。测试结果。

作者
Author: 汪杰 时间: 2024-11-29 14:44

sobereva 发表于 2024-11-28 17:48
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

好的sob老师，以后注意

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