计算化学公社

标题: PDB文件中的电荷用什么软件可以保存？ [打印本页]

作者
Author: wilely 时间: 2024-11-29 11:34
标题: PDB文件中的电荷用什么软件可以保存？
我计算了两个分子中的原子电荷保存为PDB文件（在其最后一列加上电荷），然后用软件把两个分子复合后在保存为PDB文件时，电荷那一列没有了。用什么软件和方法可以保留电荷？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-2 04:41
pdb格式本来就不记录原子电荷。pqr格式才专门有一列记录原子电荷

pqr格式在下文提到了
使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数
http://sobereva.com/425（http://bbs.keinsci.com/thread-10163-1-1.html）

作者
Author: xxx127 时间: 2025-3-21 23:30

sobereva 发表于 2024-12-2 04:41
pdb格式本来就不记录原子电荷。pqr格式才专门有一列记录原子电荷

pqr格式在下文提到了

那请教sob老师可以在pdb文件中添加电荷数据吗，vmd能识别出来吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-22 15:21

xxx127 发表于 2025-3-21 23:30
那请教sob老师可以在pdb文件中添加电荷数据吗，vmd能识别出来吗？

pdb里不记录原子电荷信息。pqr格式才记录

作者
Author: xxx127 时间: 2025-3-24 10:59

sobereva 发表于 2025-3-22 15:21
pdb里不记录原子电荷信息。pqr格式才记录

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