[更新至v1.2版本]用于绘制曲线样式的反应能量变化图的小程序 - 计算化学公社

v1.2版本更新：

打包好的可执行exe文件：

链接:https://pan.baidu.com/s/14w7-ajpArJ6Er-PI98MyzQ 提取码:ap4i

重点更新：1.修复了调整显示页面的大小会影响显示效果的问题，新版本可以随意修改页面大小和比例了。

2.优化了导出cdxml文件的页面数量，使之更加合理。

3.修复了表格中有空行时导出数据会报错的问题。

4.如果有多个标志处于相同的位置，现在只会绘制一个

新增功能：

1. 重新调整了底部工具栏的代码，现在所有功能都可以正常使用了

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1. 点击小房子按钮现在可以正常显示完整视图，效果等同于Show All

2. 前进后退按钮用于调整到前/后一个视角

3. 十字按钮左键用于拖动图像，右键拖动用于缩放,鼠标滚轮也可以缩放

4. 放大镜按钮用于矩形缩放

5. 滑块按钮用于调整显示范围

6. 点击保存图片按钮会出现对话框，输入ppi数值（比如一般期刊要求是300），可以直接保存高清大图。

2. 新增Show Grid选项，可以选择是否显示网格线

3. 表格区域现在可以右键点击数据区域的单元格，弹出菜单，此时选择删除行/列会删除单元格所在的行/列，还可以在单元格上侧/左侧添加行/列。

(, 下载次数 Times of downloads: 8)

4．新增Open Table选项，如果不小心把表格关闭了可以点击重新打开。

注；所有版本保存的数据格式都是通用的，新版本也可以打开老版本保存的数据。建议大家使用最新的版本。

**********************以下是旧版本介绍****************************

v1.1版本更新：

v1.1打包好的exe文件下载地址：

链接：https://pan.baidu.com/s/1F6dNUwhJ4gI4udoqZt6_OQ

提取码：13pu

更新内容：

1.修复了绘制多条带有圆点的曲线时输出的cdxml文件中有些圆点会在曲线图层下面的问题。

2.当生成图像过大时，程序会自动拓展生成的cdxml文件的页面个数。

3.进一步优化了显示效果，目前程序模拟的输出效果和chemdraw绘制的结果几乎一致了,因此也增加了一些新功能。

新版本界面如下：

(, 下载次数 Times of downloads: 8)

1. 增加了Curve Width 选项，用于调整曲线宽度（默认0.6）

2. 增加了Font Size 选项，用于调整字体大小（默认10.0）

3. 增加了Text Space 选项，用于调整文字和标志之间的距离（默认3.0）

4. 增加了Bond Width选项，用于调整线段的宽度（默认2.0）

5. 增加了Label-Energy Layout 选项，设置能量数值和标签的位置关系，Sperate(分开显示)，Combine（合并成一行显示）

6. 增加了Target location选项，用于设置文本和图形之间的位置关系：C (center) :中心位置，W S A D分别表示文本在图形的上/下/左/右

Sperate 和 Target location 组合在一起就可以有10种位置显示效果

7. 增加了Show Marker选项：勾选后会在屏幕中心显示一个苯环结构,大小和chemdraw中绘制的一致，用于判断曲线的大小是否合适。

(, 下载次数 Times of downloads: 7)

关于位置设置：

如果想单独设置某个标签的位置，可以在单元格中添加逗号和位置信息，比如0.0(TS1),sw。第一个字母为s或者c,代表Label-Energy Layout中的Sperate或Combine,第二个字母为c/w/s/a/d中的一个，和Target location中的一致。程序会优先读取表格中的位置信息，如果没有则读取全局设置。表格保存的同时位置信息也会保存，可以避免多次修改。

比如：

(, 下载次数 Times of downloads: 9)

剩下的在Chemdraw中微调就会很快了。

注：1. 新加的功能较多，有bug可以在评论区里反馈。

2. 修改显示窗口的纵横比会导致显示的效果和导出的效果有差别，目前还没有解决，大家使用的时候最好不要调整窗口比例。（v1.2已解决）

最近比较流行绘制曲线样式的反应能量变化图，这样看上去会更有势能面的‘’感觉‘’，但又没有找到什么工具可以直接绘制，直接在Chemdraw中手搓又过于繁琐，干脆写了个小程序，用于绘制曲线能量变化图，生成的cdxml文件可以被Chemdraw读取，方便后续编辑。使用方法如下：

该程序使用python语言编写，需要额外安装的库有numpy和matplotlib,如果对python不熟悉的话可以直接在网盘下载打包好的exe版本：

双击进入程序，会显示两个界面，数据界面如下：

(, 下载次数 Times of downloads: 9)

这个界面用于设置反应能量变化的信息。前三列分别用于设置曲线颜色，标志颜色和文本颜色，双击即可进入颜色选择界面，后面为能量信息，如果有标签的话写在括号里，比如0.0(R)。下面的按钮依次为：

1. Add Row：添加行

2. Add Column：添加列

3. Delete Row：删除最后一行

4. Delete Column：删除最后一列

5. Save Data：把表格中的数据保存在当前目录下table_data.json中

6. Load Data：读取当前目录下的table_data.json文件，用于快速恢复已经编辑好的数据。

在数据选择界面输入输入0.0(R),15.0(TS),0.0(P)，在主界面显示如下：

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下图为颜色切换界面，可以快速自定义需要的颜色：

(, 下载次数 Times of downloads: 8)

主界面的左侧会显示绘制的图形，滚轮可以放大缩小，便于观察。底部也有一些调整按钮，右侧则是调整图像的选项，分别如下：

Scale Factor: 整体放大缩小

Scale Factor x: 沿x轴放大缩小

Scale Factor y: 沿y轴放大缩小

Base curve: 用于设置曲线的弧度，数值越大曲线弧度越大，为0则变成直线

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Disp factor: 用于微调曲线，曲线x轴数值变化越大，弧度越大：

如下图所示，当两条曲线的x轴范围区别较大时单纯通过调整Base curve难以达到满意的效果：Base curve = 0.3时下面的曲线弧度已经合适，但是上面的曲线弧度太小。而当Base curve = 0.8时下面的曲线弧度又会过大，因此，可以通过调整Dispfactor使得两条曲线都具有合适的弧度。

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Curve factor: 用于微调曲线，曲线y轴数值变化越大，弧度越大。原理和效果同上，只是根据y轴数值变化。

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Bond length: 调整横线的长度

Circle Radius: 调整圆的半径

Shape：共有三个选择，分别为Line(横线)，circle（圆）和None(没有标志)，效果如下:

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Connection:设置曲线和线段或圆的的连接方式：Center(中心连接)，Side(边缘连接)

Line type:设置曲线的格式：Solid(实线)，Dash(虚线)

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Show all: 点击展示完整的曲线。

绘制完成后点击ExportCDXML即可生成output.cdxml文件

复杂的例子：（上:程序显示，下:Chemdraw输出结果）

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注：1.程序中显示的图像通过matplotlib绘制而来，尽量还原在Chemdraw中的效果，但是没法百分百还原，还是应以输出结果为准。缩放图像请使用滚轮，拖动图像点击图表下方工具栏的十字按钮。

2. 生成的cdxml文件默认的格式为ACS document 1996,字体为Arial

3. 像上图中为了实现第二条曲线从IM1出发，会导致IM1处有两组数据，记得删除其中一组。（v1.2已解决）

4. 该程序未经过大量测试，可能会有bug，及时保存。

最后如果大家有什么问题和建议都可以在本帖下留言，我会在能力所及的范围内进行修改。如果大家觉得好用的话给我点个赞即可

谢谢！