计算化学公社

标题: 一个初学者的DFT计算经验总结 [打印本页]

作者
Author: qingmang 时间: 2024-11-30 20:50
标题: 一个初学者的DFT计算经验总结
本帖最后由 qingmang 于 2025-2-3 09:42 编辑

这是一个自学且初学者的计算经验总结贴，经验来源于自己的计算经历与师兄的一些建议，主要为了以后自己回想起来这些经验，会随缘更新。欢迎大家讨论，同时也欢迎各位前辈，同学批评指正（轻喷）

…………………………………………………………………………………………………分……割……线…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

过渡态找不到，虚频变成甲基旋转或者骨架变动：
0、考虑反应是否存在很明显的活性位点（比如质子，孤对电子）通过加入其他成分（酸、碱、溶剂）来惰化
1、利用扫描，刚性扫描比较快速，一般是扫描中能量最低点（毕竟不大可能直接契合那个虚频的对应的方向），但要关注势能曲线不够平滑或者比较特殊的点，
2、在可能结构附近精细（减少步长）扫描，看看有没有合适的原子位置（扫描后的鞍点）
3、减少计算循环的步长（MexStep = 3），可以让某种二阶不稳定的结构找到可能位置（鞍点和鞍点之间亦有稳定性差别）
中间体找不到，出现甲基旋转或者骨架变动的虚频：
0、此种情况一般是势能面上两个点（鞍点与局部最小点）离得很近导致的
1、积极利用recalc，Maxstep（如：recalc=5,maxstep=3）计算二阶导，可以将两个势能面很接近的位点（鞍点，局部最小点）区分

作者
Author: typ_gauss 时间: 2024-11-30 21:12
赞！

作者
Author: awhy11 时间: 2024-12-11 10:23
可太可以了都

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-1-21 12:59
学习了！找过渡态确实是门学问

作者
Author: wyx2006 时间: 2025-1-27 10:26

学习了！

作者
Author: dylanx 时间: 2025-6-16 11:36
不错，谢谢分享

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)