计算化学公社

标题: Materials Studio生成化学键时键长不准确 [打印本页]

作者
Author: Farnesol 时间: 2024-12-6 21:21
标题: Materials Studio生成化学键时键长不准确
最近在做几类聚合物建模与优化时需要用到MS，发现在建模时MS会将许多重要的化学键键长等参数当做普通单键处理，如图所示，比如苯环内部键长应该是1.4埃左右，羰基键长应该是1.25埃左右。然而MS在指定键类型后仍然将键长自动设定为与碳碳单键及碳氧单键等同（尽管键级正确），经过dmol3与forcite等不同模块优化后键长仍然没有改进，也导致MS建模所得分子无法直接代入量子化学软件进行计算，需要手动修改键长。求教：MS的键长误差是否会对其本身的模拟结果产生较大影响？应当如何纠正这种误差，或者手动修改MS里碳碳双键等化学键的默认键长？

作者
Author: BangbooCat 时间: 2024-12-7 01:07
建立好模型后直接在cp2k、高斯等量化软件里进行几何优化，ms自带的量化模块不是很好

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-7 05:36
初始结构里键长差个0.1、0.2埃程度根本不是什么事，量子化学优化完了自发就调整合适了，没必要纠结于这种鸡毛蒜皮的事

作者
Author: Farnesol 时间: 2024-12-7 12:05

sobereva 发表于 2024-12-7 05:36
初始结构里键长差个0.1、0.2埃程度根本不是什么事，量子化学优化完了自发就调整合适了，没必要纠结于这种鸡 ...

好的，感谢sob老师

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