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标题: MS中跑forcite分子动力学出现的问题 [打印本页]

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电视机    时间: 2024-12-10 20:23
标题: MS中跑forcite分子动力学出现的问题
大佬们你们好,麻烦请问一下,我跑分子动力学总是出现这个问题。我大概明白是让我去几何优化,但是我几何优化了好多好多次,但是都是这个结果。这个是为什么呀,还有就是有的跑了一部分的那些文件,其中有几个键,他拉的老长。谢谢回答。

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jrfjrf123    时间: 2024-12-11 10:42
你可以放一下你的初始结构和几何优化后结构图

我估计是初始结构不对,偏离力场平衡点太远导致即便是在几何优化的约束条件下也会产生很大位移

或者是力场选择不对,不适用于当前体系
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电视机    时间: 2024-12-11 14:10
本帖最后由 电视机 于 2024-12-11 14:12 编辑

嗯嗯好的麻烦帮我看看。很诡异。前面是我模拟前 ,后面是我跑模拟后。




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