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标题: k点收敛性测试算出的每个k点能量都是0 [打印本页]

作者
Author: alenrose 时间: 2024-12-11 11:53
标题: k点收敛性测试算出的每个k点能量都是0
各位老师好，我使用cp2k将si.cif文件转化为.inp文件（泛函为PBE，基组为DZVP- MOLOPT- SR- GTH），然后将inp文件和xyz文件、kpconv.sh文件转到并行上，结果算出来的所有k点的能量都是0。我刚学习Linux系统，看不出问题所在，所以希望各位老师给予指导一下，非常感谢😬。以下是我的kpconv.sh文件的脚本截图和输出的sp.text文件 (, 下载次数 Times of downloads: 5)

管理员sobereva注：此脚本的出处是北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）的“能量的计算及相关问题”部分

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-11 12:03
输入输出毕竟是文本文件，适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查，现在这样分好多张截图实在麻烦。

运行CP2K的系统是有作业调度系统的超算吗，有没有先前提交作业成功跑CP2K的脚本？

这帖的问题和我回答过的http://bbs.keinsci.com/thread-50259-1-1.html类似，也可参考一下。

作者
Author: alenrose 时间: 2024-12-11 12:07

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-11 12:03
输入输出毕竟是文本文件，适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查，现在这样分好多张截图实在麻烦。

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好的谢谢老师

作者
Author: alenrose 时间: 2024-12-11 12:13

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-11 12:03
输入输出毕竟是文本文件，适当压缩后作为帖子附件上传更方便下载检查，现在这样分好多张截图实在麻烦。

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这是我提交其他作业的脚本

作者
Author: Freeman 时间: 2024-12-11 12:42
每个人写输入文件的习惯不一样，每个平台提交任务的方式都不一样，让大家看脚本有什么用呢？应该拿一个这个脚本生成的输入文件以及报错的输出文件，让大家看有什么问题。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-11 12:57

alenrose 发表于 2024-12-11 12:13
这是我提交其他作业的脚本

我楼上提到的那帖从9楼开始说了超算的问题，而我也提到了使用计算集群却没有Linux基础知识的解决方法，请先仔细看一看。

这里用的k点收敛性测试的脚本能看出来也是社长编写并在CP2K第一性原理计算培训班里提供的那个，但是仍然要提醒一下，注意正确表明出处。社长目前不用作业调度系统，他写的脚本假定了使用者是在单机Linux系统上运行CP2K，且能用$cp2k_bin或者mpirun $cp2k_bin（其他参数暂时省略）之类的命令直接启动。所以迁移到超算上使用，就得把直接启动CP2K计算的命令改成通过作业提交脚本提交CP2K任务的命令。

作者
Author: alenrose 时间: 2024-12-11 13:00

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-11 12:57
我楼上提到的那帖从9楼开始说了超算的问题，而我也提到了使用计算集群却没有Linux基础知识的解决方法，请 ...

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