计算化学公社

标题: 请问这个模型的电荷数和自旋多重度该怎么设置 [打印本页]

作者
Author: jiangxiaohahaha 时间: 2024-12-12 13:50
标题: 请问这个模型的电荷数和自旋多重度该怎么设置
请问各位老师，这个结构的电荷数和自旋多重度该怎么设置，我尝试设置1，2，4 结构优化都不收敛。
计算中间两个(MnF6)2-

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-12 14:04
这是个什么结构，K2SiF6晶体抠出来一块再替换两个硅为锰？几何优化和振动分析的目的是什么？

周期性体系用CP2K等第一性原理程序做计算更合适，如果没有接触过推荐参加一个CP2K第一性原理计算培训班。

作者
Author: jiangxiaohahaha 时间: 2024-12-12 14:12

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-12 14:04
这是个什么结构，K2SiF6晶体抠出来一块再替换两个硅为锰？几何优化和振动分析的目的是什么？

周期性体系 ...

是的老师，替换两个硅，做完优化想去计算激发态能量用td，但结构不收敛，不知道这种大的结构自旋多重度该怎么设置，锰是Mn4+

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-12 14:31

jiangxiaohahaha 发表于 2024-12-12 14:12
是的老师，替换两个硅，做完优化想去计算激发态能量用td，但结构不收敛，不知道这种大的结构自旋多重度该 ...

现在最明显的问题是建模和计算从一开始就不合理，晶体里面直接抠一块出来不加任何处理哪能真实表现周期性体系的环境，而且B3LYP/6-31G的级别也不合适。

改用CP2K好了，做大体系周期性晶格的电子激发计算足够高效，在上面科音培训班的链接里搜TDDFT就能看到相关部分的介绍。

当然CP2K计算也要考虑自旋多重度，四价锰和六个氟形成配合物的自旋多重度可以用晶体场理论判断，但这是后话了，先把上面的问题搞清楚再说。

作者
Author: jiangxiaohahaha 时间: 2024-12-12 15:09

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-12 14:31
现在最明显的问题是建模和计算从一开始就不合理，晶体里面直接抠一块出来不加任何处理哪能真实表现周期性 ...

谢谢老师，但我用的集群只能用g16或者orca 请问老师该如何判断四价锰和六个氟形成的配合物的自旋多重度呢？我理解是因为氟是弱场配体所以形成高自旋状态，因此基态的自旋多重度应该设置为4。还请老师不要生气，学生刚开始进行计算，理论学习部分还是很欠缺。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-12 16:14

jiangxiaohahaha 发表于 2024-12-12 15:09
谢谢老师，但我用的集群只能用g16或者orca 请问老师该如何判断四价锰和六个氟形成的配合物的自旋多重度呢 ...

不用叫老师哦，毕竟我没做过这种课题，只是路过好奇看看计算模型顺便指个路而已，没有任何生气的意思，抱歉语气有点强硬了……

对孤立的分子或团簇等体系做量子化学计算，对周期性重复的固体或溶液等体系做第一性原理计算，是两类从建模到计算都明显不同的研究方法。Gaussian和ORCA属于前者，而后者需要CP2K等处理，可以读一读社长写的这篇博文了解。
辨析计算化学中的任务类型和理论方法
http://sobereva.com/680（http://bbs.keinsci.com/thread-38982-1-1.html）

我觉得最好还是努努力跟管理集群的人申请一下，毕竟有具体研究课题的需求在此，举几个以往研究工作应该能说明问题。而且相比另一个做第一性原理计算的软件VASP，上面科音培训班讲的CP2K又开源免费又高效快速还有丰富功能，在集群上部署好是很划算的。

按晶体场理论的简单判断，八面体型[MnF6]2-配离子在基态有三个t2g自旋平行的单电子，则自旋多重度确实是4。但是不能排除多个配离子在当前研究体系中相互作用产生其他电子自旋态的可能。

作者
Author: jiangxiaohahaha 时间: 2024-12-12 22:54

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-12 16:14
不用叫老师哦，毕竟我没做过这种课题，只是路过好奇看看计算模型顺便指个路而已，没有任何生气的意思，抱 ...

谢谢老师！我主要是做分子体系的，只是这个结构不是很清楚，主要还是用g16和orca去做计算。这个结构主要算锰的激发态能量，但只算mnf6又和文献差距过大，文献是使用molcas设置AIMP模拟晶体场，但我不会用molcas，因此想尝试用一个小的体系去当环境再去做激发态计算。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-12-13 21:22

jiangxiaohahaha 发表于 2024-12-12 22:54
谢谢老师！我主要是做分子体系的，只是这个结构不是很清楚，主要还是用g16和orca去做计算。这个结构主要 ...

哎，本来应该在一楼就把这些说清楚，这样能更容易找来专业的人回帖解答问题，而不是我在这扯半天还说不到关键点上了。建议阅读社长这篇博文。
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

从周期性体系取部分建立簇模型当孤立体系计算或许也行，但是扩胞、处理表面、添加背景电荷和/或溶剂模型、选择计算级别等操作是会有点麻烦，显然一楼那个输入文件过于简单了。听听其他人的意见吧。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)