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标题: 关于CP2K中如何实现采用平均力势法计算AIMD轨迹化学反应的自由能变 [打印本页]

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ljh123    时间: 2024-12-16 16:36
标题: 关于CP2K中如何实现采用平均力势法计算AIMD轨迹化学反应的自由能变
对于平均力势法计算动力学轨迹的自由能变,应该是用离散的方法计算沿反应坐标的平均力势,并积分得到自由能变。对于CP2K中如何实现这个计算,我的理解是沿着反应坐标,通过colvar设定约束变量。例如反应坐标是键长,那我就分别设置0.1埃、0.2埃。。。。分别跑无偏动力学模拟。然后通过输出的文件找到约束力并求每段轨迹各自的时间平均,最后在积分。请问下大家这样的理解是否合理呢






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