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标题: 采用gaussian计算Zn晶面上水分子吸附能的相关设置问题 [打印本页]

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Author: Dreamer1 时间: 2024-12-17 02:53
标题: 采用gaussian计算Zn晶面上水分子吸附能的相关设置问题
老师好，我在使用gaussian计算Zn002晶面与水分子之间的吸附能，如图所示。有以下问题（1）我是否可以先对晶面结构进行单独的优化，然后再在优化的结构上建水分子的模，然后再整体进行几何优化算能量？（2）之前算过一次石墨烯炭层对有机小分子的吸附能，采用的是B3LYP-D3(BJ)/6-311G*优化，B3LYP-D3(BJ)/6-311+G(2d,p)计算能量，考虑counterpoise；那么这样的方法是否也可以用于计算上述的Zn晶面对水分子的吸附能？（3）如果判断水分子之间的O与Zn会产生相互作用，那么在几何优化前，是否需要把O与晶面的某个Zn原子连接成键再进行优化？ (, 下载次数 Times of downloads: 4)

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Author: wzkchem5 时间: 2024-12-17 04:03
这种体系不要用高斯算，用CP2K算，又快（有ADMM加速）又准（有周期性条件）还免费

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Author: sobereva 时间: 2024-12-17 05:56
1 先单独优化晶面没什么意义，白多花时间

2 石墨烯吸附小分子，和你当前的簇模型有天壤之别。当前一大堆Zn，全都用全电子基组巨贵

3 不需要。本来DFT计算就不依赖于成键关系，属于基本量子化学常识。摆个合适的结构当初猜就完了

当前模型非要用量子化学程序算也能算，下文也给了类似例子，但是耗时相当高，远不如用CP2K，又能完美考虑周期性，耗时还只有Gaussian算这个的零头。通过北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）学习CP2K的话很快就能用CP2K顺利跑起来这个计算。

使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540（http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html）

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Author: Dreamer1 时间: 2024-12-17 12:53

sobereva 发表于 2024-12-17 05:56
1 先单独优化晶面没什么意义，白多花时间

2 石墨烯吸附小分子，和你当前的簇模型有天壤之别。当前一大堆 ...

好的，谢谢老师的指导

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