标题: 模拟崩溃press scaling more than 1% [打印本页] 作者Author: zhangfaxue 时间: 2024-12-24 11:57 标题: 模拟崩溃press scaling more than 1% 模拟体系中是水、一些烷烃分子,使用GROMOS 54 A7 力场 ,先进行了能量最小化然后准备跑一个短时间的NPT让体系先平衡,但是一运行就提示press scaling more than 1%,查看之前的提示发现有the largest distance between excluded atoms is 1994 nm between atom 7747 ,which is larger than the cut-off distance.检查结构发现这两原子结构并未出现异常,本就是一个分子中两个间隔1.994nm距离的原子。
于是按照卢老师给的方法逐一排查,依旧提示如下错误,花费很长时间依旧没有进展,请教各位哪里出了问题?