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标题: gmx报错提示larger than the cut-off distance [打印本页]

作者
Author: NGC626 时间: 2024-12-24 17:30
标题: gmx报错提示larger than the cut-off distance
各位老师好，我在使用这篇帖子中的windows版gmx时http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 5&highlight=windows，出现了如下报错，请问可能是什么原因导致的呢？应如何修改拓扑文件和mdp文件呢？输入文件如下

作者
Author: NGC626 时间: 2024-12-27 20:59
本帖最后由 NGC626 于 2024-12-27 21:01 编辑

重新构建盒子解决了此问题。因为我之前是先把一个5*5*5的甲苯盒子跑了平衡，再用solvate重新插入到一个4*4*11的新盒子里，插入的时候有一些甲苯分子放在了盒子外面，之后我重新跑了一个5*5*20的甲苯盒子，然后再放进4*4*11的盒子里，就没啥问题了。

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