计算化学公社

标题: 使用solvateBox添加溶剂最后结构很奇异 [打印本页]

作者
Author: t675210552 时间: 2024-12-25 20:34
标题: 使用solvateBox添加溶剂最后结构很奇异
各位大佬，我在使用tleap构建蛋白复合物模型时，使用solvateBox向体系中添加水分子，添加过程没有报错，但是最后savepdb得到的结构如图所示，感觉有一根水分子组成的柱子插在中间。
我尝试过更改盒子的尺寸，得到一样的结果，请教一下是什么原因造成的？或者应当如何去修正？
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作者
Author: Serious 时间: 2024-12-26 10:47
1）很难帮你分析，先把tleap命令列出来吧。。必要时可能还得要原文件。。

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