计算化学公社

标题: 求助sobEDAw的w值为几十上百次幂? [打印本页]

作者
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藤井树    时间: 2024-12-27 15:31
标题: 求助sobEDAw的w值为几十上百次幂?
B3LYP-D3(BJ)/6-311+G(2d,p)计算水平下的sobEDAw计算结果如附件所示。


如题,w值为几十上百次幂?十分疑惑,结果是否还能使用呢?



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sobereva    时间: 2024-12-27 20:08
没具体输入文件没法判断,可能哪设置的不对
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藤井树    时间: 2024-12-28 08:21
sobereva 发表于 2024-12-27 20:08
没具体输入文件没法判断,可能哪设置的不对

sob老师好,谢谢您的回复。

我是在分子动力学模拟后提取的团簇中,将中心分子与外围分子分别提取组合成多对dimer进行批量计算的,理论上来说输入文件的形式是一致的,区别就在于外围分子的坐标上,可能是单独关注这一对dimer的时候计算的结果不是很合理?

老师那这种情况下,数据还能使用吗?

作者
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sobereva    时间: 2024-12-28 12:32
藤井树 发表于 2024-12-28 08:21
sob老师好,谢谢您的回复。

我是在分子动力学模拟后提取的团簇中,将中心分子与外围分子分别提取组合 ...

你是指同样手段取dimer,有的dimer结构下结果合理、有的不合理?如果是这样,你得把给sobEDA计算用的所有文件都上传,我才能检查是怎么回事
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藤井树    时间: 2024-12-28 14:39
本帖最后由 藤井树 于 2024-12-30 08:19 编辑
sobereva 发表于 2024-12-28 12:32
你是指同样手段取dimer,有的dimer结构下结果合理、有的不合理?如果是这样,你得把给sobEDA计算用的所有 ...

是的sob老师,我就是这个意思。

以下是我的计算涉及文件,包含团簇结构和已经计算完毕的三对dimer,其中存在问题的是dimer2的计算结果。

谢谢您的指点。

作者
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sobereva    时间: 2024-12-28 15:01
我看了,当前情况没问题
数值之所以那么大是因为当前的静电作用数值极小,它是分母,使得计算权重系数的指数项特别大。当前结构下有显著静电作用的原子间距离普遍很远,所以这并不意外
作者
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藤井树    时间: 2024-12-30 16:47
sobereva 发表于 2024-12-28 15:01
我看了,当前情况没问题
数值之所以那么大是因为当前的静电作用数值极小,它是分母,使得计算权重系数的指 ...

明白了,谢谢sob老师




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